C'est une "folie" de prétendre que l'ADN est le principal plan directeur de la vie

Enfin, un peu de bon sens émerge du bastion de la "science institutionnalisée" – la génétique. Après avoir passé plus d'un siècle à proclamer que l'ADN est le concept central qui dirige la vie, l'hérédité, la santé et la médecine de la longévité a maintenant perdu tout espoir de produire quelque chose d'utile avec toutes ces hypothèses idiotes. Heureusement, la vision centrée sur le génome n'a jamais complètement conquis le domaine de la biologie et des groupes isolés de scientifiques ont continué à travailler sur des idées plus nuancées et plus dérivées expérimentalement telles que les champs morphogénétiques, l'hérédité épigénétique, les interactions/effets cellulaires à longue portée, etc. Les deux dernières études ci-dessous admettent enfin que la vision centrée sur le génome de la biologie/la vie n'est rien de moins qu'une "folie". Apparemment, l'ADN n'est rien de plus qu'une liste d'"ingrédients", non seulement insuffisante en soi pour créer un organisme vivant, mais n'ayant aucun rôle réel en tant que "manuel d'instructions". Il semble que l'ADN ne soit qu'UNE des "entités" utilisées pour construire un organisme vivant. D'autres entités cruciales incluent même de petites (par rapport aux peptides ou à l'ADN/ARN) molécules (ATP, ions, etc.) ainsi que leurs propriétés telles que le type, la concentration, les combinaisons, etc. Certaines de ces "entités" de la vie sont capables de détecter les propriétés d'autres entités et d'ajuster la structure de l'organisme en conséquence et de manière continue. En d'autres termes, si un organisme vivant est une structure similaire à une maison, l'ADN n'est même pas comparable aux briques individuelles. Au mieux, c'est UN type de brique parmi une multitude d'autres types utilisés pour construire une maison. La structure de la maison dépend BOTH de ses entités et de l'ajustement dynamique basé sur la capacité de la "maison" à sentir son environnement et à s'adapter en conséquence. Sans capturer toutes ces informations, il est en effet rien de moins qu'une "folie" de prétendre que l'ADN seul est un plan directeur et un bloc de construction suffisant de la vie. Un organisme vivant est un système dynamique et entièrement unique qui change constamment, et à ce titre ne peut pas être recréé à l'identique à partir d'un ensemble statique d'instructions (ADN), qui s'avère maintenant même incomplet ! Toutes ces informations – les entités, leurs capteurs et les propriétés du système, et son environnement – sont transmises à la descendance, et bien que la descendance puisse contenir certains des mêmes blocs de construction (ADN), elle sera un organisme unique en raison de la nature toujours changeante de l'environnement dans lequel elle vit. Peut-être encore plus important, ce cadre d'hérédité considère comme parfaitement normal de transmettre des informations acquises (la fameuse nature) aux générations suivantes sans AUCUN changement dans le code génétique lui-même. C'est un pas en avant par rapport aux vues actuellement dominantes en épigénétique où certains changements non génétiques sont à contrecœur acceptés comme héréditaires mais ils sont encore strictement limités aux motifs de méthylation de l'ADN. Les dogmes épigénétiques actuels ne permettent certainement pas la transmission d'informations telles que, par exemple, les niveaux moyens d'ATP ou les concentrations de magnésium dans le cerveau. Le nouveau cadre ci-dessous semble fournir un mécanisme pour une telle hérédité de caractéristiques acquises à l'échelle de l'organisme. Enfin, ce nouveau cadre jette un froid sur les affirmations selon lesquelles la science pourra un jour ressusciter des espèces éteintes en se basant uniquement sur l'ADN qu'elle a réussi à récupérer à partir de quelque carcasse bien préservée. Comme les études ci-dessous l'expliquent habilement, la créature recréée purement à partir de matériel ADN aura très peu à voir avec l'espèce originale.

https://royalsocietypublishing.org/doi/10.1098/rsif.2020.0154

« …Ici, je développe un cadre pour l'hérédité et le développement qui inclut les régulateurs cycliques analysés en termes de ce qu'un organisme peut sentir à son sujet et de son environnement en définissant des entités, leurs capteurs et les propriétés perçues. Les entités incluent les petites molécules (ATP, ions, métabolites, etc.), les macromolécules (protéines individuelles, ARN, polysaccharides, etc.) et les assemblages de molécules. Alors que la concentration peut être la seule propriété pertinente mesurée par les capteurs pour les petites molécules, plusieurs propriétés qui incluent la concentration, la séquence, la conformation et la modification peuvent toutes être mesurées pour les macromolécules et les assemblages. Chaque configuration de ces entités et capteurs qui est recréée dans les générations successives dans un environnement donné spécifie ainsi une quantité potentiellement vaste d'informations pilotant un développement complexe dans chaque génération. Ce cadre entité-capteur-propriété explique comment les capteurs limitent le nombre d'états discernables, comment des configurations moléculaires distinctes peuvent être fonctionnellement équivalentes et comment la régulation des capteurs empêche la détection de certaines perturbations. »

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/bies.201900254

https://phys.org/news/2020-04-dna-life-bookjust-jumbled-ingredients.html

« …La vision commune de l'hérédité est que toute l'information transmise d'une génération à l'autre est stockée dans l'ADN d'un organisme. Mais Antony Jose, professeur associé de biologie cellulaire et de génétique moléculaire à l'Université du Maryland, n'est pas d'accord…Dans deux nouveaux articles, Jose soutient que l'ADN n'est qu'une liste d'ingrédients, pas le jeu d'instructions utilisé pour construire et maintenir un organisme vivant. Les instructions, dit-il, sont beaucoup plus compliquées, et elles sont stockées dans les molécules qui régulent l'ADN d'une cellule et d'autres systèmes fonctionnels. »

« …L'argument de Jose suggère que les scientifiques pourraient négliger des avenues importantes pour étudier et traiter les maladies héréditaires, et les croyances actuelles sur l'évolution pourraient être trop centrées sur le rôle du génome, qui contient tout l'ADN d'un organisme. L'ADN ne peut pas être considéré comme le 'plan directeur' de la vie, a déclaré Jose. Au mieux, c'est une liste d'ingrédients chevauchants et potentiellement embrouillés qui est utilisée différemment par différentes cellules à différents moments. Par exemple, le gène de la couleur des yeux existe dans chaque cellule du corps, mais le processus qui produit la protéine pour la couleur des yeux n'a lieu que pendant une étape spécifique du développement et uniquement dans les cellules qui constituent la partie colorée des yeux. Cette information n'est pas stockée dans l'ADN. De plus, les scientifiques sont incapables de déterminer la forme complexe d'un organisme tel qu'un œil, ou qu'une créature aura des yeux, en lisant l'ADN de la créature. Ces aspects fondamentaux de l'anatomie sont dictés par quelque chose en dehors de l'ADN. Jose soutient que ces aspects du développement, qui permettent à un œuf fécondé de croître d'une seule cellule en un organisme complexe, doivent être considérés comme une partie intégrante de l'hérédité. Le nouveau cadre de Jose recadre l'hérédité comme un système d'information complexe et en réseau dans lequel toutes les molécules régulatrices qui aident la cellule à fonctionner peuvent constituer un stock d'information héréditaire. »

« …Jose propose que les instructions non codées dans l'ADN sont contenues dans l'arrangement des molécules au sein des cellules et leurs interactions les unes avec les autres. Cet arrangement de molécules est préservé et transmis d'une génération à l'autre. Dans ses articles, le cadre de Jose recadre l'hérédité comme les effets combinés de trois composants : entités, capteurs et propriétés. Les entités incluent le génome et toutes les autres molécules au sein d'une cellule nécessaires pour construire un organisme. Les entités peuvent changer au fil du temps, mais elles sont recréées avec leur structure, leur arrangement et leurs interactions d'origine au début de chaque génération. Cet aspect de l'hérédité, que l'arrangement des molécules est similaire d'une génération à l'autre, est profondément sous-estimé, et il conduit à toutes sortes de malentendus sur le fonctionnement de l'hérédité, a déclaré Jose. Les capteurs sont des entités spécifiques qui interagissent avec et répondent à d'autres entités ou à leur environnement. Les capteurs répondent à certaines propriétés, telles que l'arrangement d'une molécule, sa concentration dans la cellule ou sa proximité avec une autre molécule. Ensemble, les entités, les capteurs et les propriétés permettent à un organisme vivant de sentir ou de 'savoir' des choses sur lui-même et son environnement. Certaines de ces connaissances sont utilisées avec le génome dans chaque génération pour construire un organisme. Ce cadre est construit sur des années de recherche expérimentale dans de nombreux laboratoires, y compris le nôtre, sur l'épigénétique et la silencing génique multigénérationnelle combinée à notre intérêt croissant pour la biologie théorique, a déclaré Jose. Étant donné que deux personnes qui contractent la même maladie ne montrent pas nécessairement les mêmes symptômes, nous avons vraiment besoin de comprendre tous les endroits où deux personnes peuvent être différentes – pas seulement leurs génomes.** La folie de maintenir une vision centrée sur le génome de l'hérédité, selon Jose, est que les scientifiques pourraient manquer des opportunités de combattre les maladies héréditaires et de comprendre les secrets de l'évolution. En médecine, par exemple, la recherche sur les raisons pour lesquelles les maladies héréditaires affectent les individus différemment se concentre sur les différences génétiques et sur les différences chimiques ou physiques des entités. Mais ce nouveau cadre suggère que les chercheurs devraient chercher des différences non génétiques dans les cellules des individus atteints de maladies héréditaires, telles que l'arrangement des molécules et leurs interactions. Les scientifiques n'ont pas actuellement de méthodes pour mesurer certaines de ces choses, donc ce travail pointe vers de potentiellement importantes nouvelles avenues de recherche. En évolution, le cadre de Jose suggère que les organismes pourraient évoluer par des changements dans l'arrangement des molécules sans changements dans leur séquence d'ADN. Et en science de la conservation, ce travail suggère que les tentatives de préserver les espèces en danger par des banques d'ADN seules manquent des informations critiques stockées dans les molécules non-ADN. »